"റ്റുബാക്കോ മൊസൈക്ക് വൈറസ്" എന്ന താളിന്റെ പതിപ്പുകൾ തമ്മിലുള്ള വ്യത്യാസം

വിക്കിപീഡിയ, ഒരു സ്വതന്ത്ര വിജ്ഞാനകോശം.
"Tobacco mosaic virus" എന്ന താൾ പരിഭാഷപ്പെടുത്തിയത്.
വരി 14: വരി 14:
== ഘടന ==
== ഘടന ==
{{Infobox nonhuman protein|Name=''Tobacco mosaic virus'' coat protein|image=Tobacco Mosaic Virus structure.png|Organism=Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) (TMV strain U2)|width=|caption=A monomeric unit of the ''Tobacco mosaic virus'' coat protein.<ref name="pmid3952490">{{PDB|1VTM}}; {{cite journal | vauthors = Namba K, Stubbs G | title = Structure of tobacco mosaic virus at 3.6 A resolution: implications for assembly | journal = Science | volume = 231 | issue = 4744 | pages = 1401–6 | date = March 1986 | pmid = 3952490 | doi = 10.1126/science.3952490 }}</ref>|Symbol=CP|EntrezGene=1494073|PDB=|UniProt=P03579}}
{{Infobox nonhuman protein|Name=''Tobacco mosaic virus'' coat protein|image=Tobacco Mosaic Virus structure.png|Organism=Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) (TMV strain U2)|width=|caption=A monomeric unit of the ''Tobacco mosaic virus'' coat protein.<ref name="pmid3952490">{{PDB|1VTM}}; {{cite journal | vauthors = Namba K, Stubbs G | title = Structure of tobacco mosaic virus at 3.6 A resolution: implications for assembly | journal = Science | volume = 231 | issue = 4744 | pages = 1401–6 | date = March 1986 | pmid = 3952490 | doi = 10.1126/science.3952490 }}</ref>|Symbol=CP|EntrezGene=1494073|PDB=|UniProt=P03579}}
[[പ്രമാണം:TMV_structure_full.png|ഇടത്ത്‌|ലഘുചിത്രം|319x319ബിന്ദു| ടി‌എം‌വിയുടെ ചിത്രരൂപത്തിലുള്ള മാതൃക: 1. ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ( [[ആർ. എൻ. എ.|ആർ‌എൻ‌എ]] ), 2. ക്യാപ്‌സോമർ പ്രോട്ടീൻ ( പ്രോട്ടോമർ ), 3. ക്യാപ്‌സിഡ് ]]
[[പ്രമാണം:TMV_structure_full.png|ഇടത്ത്‌|ലഘുചിത്രം|319x319ബിന്ദു| ടി‌എം‌വിയുടെ ചിത്രരൂപത്തിലുള്ള മാതൃക: 1. ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ( [[ആർ. എൻ. എ.|ആർ‌എൻ‌എ]] ), 2. ക്യാപ്‌സോമർ പ്രോട്ടീൻ ( പ്രോട്ടോമർ ), 3. [[ ക്യാപ്‌സിഡ് |ക്യാപ്‌സിഡ്]] ]]
[[പ്രമാണം:Tobacco_mosaic_virus_structure.png|പകരം=tobacco|വലത്ത്‌|ചട്ടരഹിതം|240x240ബിന്ദു]]
[[പ്രമാണം:Tobacco_mosaic_virus_structure.png|പകരം=tobacco|വലത്ത്‌|ചട്ടരഹിതം|240x240ബിന്ദു]]
''റ്റുബാക്കോ മൊസൈക് വൈറസിന്'' ദണ്ഡ്പോലുള്ള രൂപമാണുള്ളത്. ഇതിന്റെ [[ ക്യാപ്‌സിഡ് |കാപ്സിഡ്]] നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നത് കോട്ട് പ്രോട്ടീന്റെ 2130 [[തന്മാത്ര|തന്മാത്രകൾ]] കൊണ്ടും (ഇടതുവശത്തുള്ള ചിത്രംകാണുക) 6400 ബേസുകൾ നീളമുള്ള ജീനോമിക് സിംഗിൾ സ്ട്രാന്റ് ആർ‌എൻ‌എയുടെ ഒരു തന്മാത്ര കൊണ്ടുമാണ്. ആർ‌എൻ‌എയ്‌ക്ക് ചുറ്റുമുള്ള കോട്ട് പ്രോട്ടീൻ ദണ്ഡു പോലുള്ള ഹെലിക്കൽ ഘടനയിലേക്ക് (ഹെലിക്സിന്റെ ഓരോ ചുറ്റിലും 16.3 പ്രോട്ടീനുകൾ ഉണ്ട്) സ്വയം ക്രമീകരിക്കപ്പെടുന്നു; ഇത് ഒരു ഹെയർപിൻ ലൂപ്പ് ഘടനയാണ് സൃഷ്ടിക്കുന്നത് (മുകളിലുള്ള [[ഇലക്ട്രോൺ സൂക്ഷ്മദർശിനി|ഇലക്ട്രോൺ സൂക്ഷ്മദർശിനിയിൽ]] നിന്നുമുള്ള ദൃശ്യം കാണുക). പ്രോട്ടീൻ മോണോമറിൽ 158 [[അമിനോ അമ്ലം|അമിനോ ആസിഡുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു]], അവ കൂടിച്ചേർന്ന് നാല് പ്രധാന ആൽഫഹെലിക്സുകളായി മാറുന്നു, അവ വൈറോണിന്റെ അച്ചുതണ്ടിന് സമീപമുള്ള ഒരു പ്രമുഖ ലൂപ്പുമായിച്ചേരുന്നു. വൈറോണുകൾക്ക് ~ 300നാനോമീറ്റർ നീളവും ~ 18നാനോമീറ്റർ വ്യാസവുമാണുള്ളത്.<ref name="isbn0-7167-1843-X">{{Cite book|url=https://archive.org/details/biochemistry3rdedi00stry|title=Biochemistry|last=Stryer|first=Lubert|publisher=W.H. Freeman|year=1988|isbn=978-0-7167-1843-7|edition=|location=San Francisco|name-list-format=vanc|url-access=registration}}</ref> നെഗറ്റീവ് സ്റ്റെയിൻ ചെയ്ത ഇലക്ട്രോൺ മൈക്രോഫോട്ടോഗ്രാഫുകൾ കാണിക്കുന്നത് അകത്തുള്ള ചാനലിന് ~2 നാനോമീറ്റർ ആരമുണ്ടെന്നാണ്. ~ 4 നാനോമീറ്റർ ആരത്തിൽ സ്ഥിതിചെയ്യുന്ന ആർ‌എൻ‌എ സംരക്ഷിക്കപ്പെടിരിക്കുന്നത് കോട്ട് പ്രോട്ടീനിന്റെ സെല്ലുലാർ എൻസൈമുകളുടെ പ്രവർത്തനത്താലാണ്.<ref name="pmid10212932">{{Cite journal|title=The tobacco mosaic virus particle: structure and assembly|journal=Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences|volume=354|issue=1383|pages=531–5|date=March 1999|pmid=10212932|pmc=1692534|doi=10.1098/rstb.1999.0404}}</ref> 3.6 Å റെസല്യൂഷനിൽ ഒരു ഇലക്ട്രോൺ ഡെൻസിറ്റി മാപ്പ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയാണ് വൈറസിന്റെ എക്സ്-റേ ഫൈബർ ഡിഫ്രാക്ഷൻ ഘടന പഠിച്ചത്. കാപ്സിഡ് ഹെലിക്സിനുള്ളിൽ, മധ്യഭാഗത്തിനടുത്തായി, 6,395 ± 10 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ ചേർന്ന ചുരുളുകളുള്ള ആർ‌എൻ‌എ തന്മാത്രയുണ്ട്. <ref name="PNA-Goelet">{{Cite journal|title=Nucleotide sequence of tobacco mosaic virus RNA|language=English|journal=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|volume=79|issue=19|pages=5818–22|date=October 1982|pmid=6964389|pmc=347001|doi=10.1073/pnas.79.19.5818|bibcode=1982PNAS...79.5818G}}</ref> <ref name="EMBL-EBI">{{Cite web|url=https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/V01408.1|title=Sequence: V01408.1|access-date=28 March 2020|website=European Nucleotide Archive|publisher=[[EMBL]]- [[European Bioinformatics Institute|EBI]]|language=English|quote=International central site for archiving nucleic acid sequence. The reference standard in international science.}}</ref>


== ഭൗതികരാസഗുണവിശേഷങ്ങൾ ==
== ഭൗതികരാസഗുണവിശേഷങ്ങൾ ==

12:09, 21 സെപ്റ്റംബർ 2020-നു നിലവിലുണ്ടായിരുന്ന രൂപം

ERROR: parameter(s) specifying taxon are incorrect; see documentation
Transmission electron micrograph of TMV particles negative stained to enhance visibility at 160,000× magnification
Transmission electron micrograph of TMV particles negative stained to enhance visibility at 160,000× magnification
Virus classification e


ടൊബാമോവൈറസ് ജനുസ്സിൽ ഉൾപ്പെടുന്ന പോസിറ്റീവ്-സെൻസ് സിംഗിൾ-സ്ട്രാൻഡഡ് ആർ‌എൻ‌എ വൈറസ് സ്പീഷീസാണ് ടൊബാക്കോ മൊസൈക് വൈറസ് ( ടി‌എം‌വി ), ഇത്, പ്രത്യേകിച്ച് പുകയിലയേയും സോളനേസി കുടുംബത്തിലെ മറ്റ് അംഗങ്ങളേയും ഉൾപ്പെടെ വൈവിധ്യമാർന്ന സസ്യങ്ങളെയാണ് ബാധിക്കുന്നത്. ഈ വൈറസിന്റെ ബാധമൂലം " മൊസൈക്കിന്റെ " പോലെയുള്ള അടയാളങ്ങൾ (വൈറസിന് ഈ പേര് വരാനുള്ള കാരണമിതാണ്), നിറവ്യത്യാസം എന്നിങ്ങനെയുള്ള പ്രത്യേക പാറ്റേണുകൾ ഇലകളിൽ ഉണ്ടാക്കുന്നു. ആദ്യമായി കണ്ടെത്തിയ വൈറസാണ് ടിഎംവി. പത്തൊൻപതാം നൂറ്റാണ്ടിന്റെ അവസാനം മുതൽ ഒരു ബാക്ടീരിയേതര അണുബാധ പുകയില വിളകൾക്ക് നാശമുണ്ടാക്കുന്നുവെന്ന് അറിയാമായിരുന്നെങ്കിലും, 1930 വരെ രോഗകാരി ഒരു വൈറസാണെന്ന് തിരിച്ചറിഞ്ഞിരുന്നില്ല. രോഗകാരിയായി തിരിച്ചറിഞ്ഞ ആദ്യ വൈറസാണ് ഇത്.

ഘടന

Tobacco mosaic virus coat protein
A monomeric unit of the Tobacco mosaic virus coat protein.[1]
Identifiers
Organism Tobacco mild green mosaic virus (TMGMV) (TMV strain U2)
Symbol CP
Entrez 1494073
UniProt P03579
Other data
ടി‌എം‌വിയുടെ ചിത്രരൂപത്തിലുള്ള മാതൃക: 1. ന്യൂക്ലിക് ആസിഡ് ( ആർ‌എൻ‌എ ), 2. ക്യാപ്‌സോമർ പ്രോട്ടീൻ ( പ്രോട്ടോമർ ), 3. ക്യാപ്‌സിഡ്
tobacco

റ്റുബാക്കോ മൊസൈക് വൈറസിന് ദണ്ഡ്പോലുള്ള രൂപമാണുള്ളത്. ഇതിന്റെ കാപ്സിഡ് നിർമ്മിച്ചിരിക്കുന്നത് കോട്ട് പ്രോട്ടീന്റെ 2130 തന്മാത്രകൾ കൊണ്ടും (ഇടതുവശത്തുള്ള ചിത്രംകാണുക) 6400 ബേസുകൾ നീളമുള്ള ജീനോമിക് സിംഗിൾ സ്ട്രാന്റ് ആർ‌എൻ‌എയുടെ ഒരു തന്മാത്ര കൊണ്ടുമാണ്. ആർ‌എൻ‌എയ്‌ക്ക് ചുറ്റുമുള്ള കോട്ട് പ്രോട്ടീൻ ദണ്ഡു പോലുള്ള ഹെലിക്കൽ ഘടനയിലേക്ക് (ഹെലിക്സിന്റെ ഓരോ ചുറ്റിലും 16.3 പ്രോട്ടീനുകൾ ഉണ്ട്) സ്വയം ക്രമീകരിക്കപ്പെടുന്നു; ഇത് ഒരു ഹെയർപിൻ ലൂപ്പ് ഘടനയാണ് സൃഷ്ടിക്കുന്നത് (മുകളിലുള്ള ഇലക്ട്രോൺ സൂക്ഷ്മദർശിനിയിൽ നിന്നുമുള്ള ദൃശ്യം കാണുക). പ്രോട്ടീൻ മോണോമറിൽ 158 അമിനോ ആസിഡുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു, അവ കൂടിച്ചേർന്ന് നാല് പ്രധാന ആൽഫഹെലിക്സുകളായി മാറുന്നു, അവ വൈറോണിന്റെ അച്ചുതണ്ടിന് സമീപമുള്ള ഒരു പ്രമുഖ ലൂപ്പുമായിച്ചേരുന്നു. വൈറോണുകൾക്ക് ~ 300നാനോമീറ്റർ നീളവും ~ 18നാനോമീറ്റർ വ്യാസവുമാണുള്ളത്.[2] നെഗറ്റീവ് സ്റ്റെയിൻ ചെയ്ത ഇലക്ട്രോൺ മൈക്രോഫോട്ടോഗ്രാഫുകൾ കാണിക്കുന്നത് അകത്തുള്ള ചാനലിന് ~2 നാനോമീറ്റർ ആരമുണ്ടെന്നാണ്. ~ 4 നാനോമീറ്റർ ആരത്തിൽ സ്ഥിതിചെയ്യുന്ന ആർ‌എൻ‌എ സംരക്ഷിക്കപ്പെടിരിക്കുന്നത് കോട്ട് പ്രോട്ടീനിന്റെ സെല്ലുലാർ എൻസൈമുകളുടെ പ്രവർത്തനത്താലാണ്.[3] 3.6 Å റെസല്യൂഷനിൽ ഒരു ഇലക്ട്രോൺ ഡെൻസിറ്റി മാപ്പ് അടിസ്ഥാനമാക്കിയാണ് വൈറസിന്റെ എക്സ്-റേ ഫൈബർ ഡിഫ്രാക്ഷൻ ഘടന പഠിച്ചത്. കാപ്സിഡ് ഹെലിക്സിനുള്ളിൽ, മധ്യഭാഗത്തിനടുത്തായി, 6,395 ± 10 ന്യൂക്ലിയോടൈഡുകൾ ചേർന്ന ചുരുളുകളുള്ള ആർ‌എൻ‌എ തന്മാത്രയുണ്ട്. [4] [5]

ഭൗതികരാസഗുണവിശേഷങ്ങൾ

ഒരു തെർമോസ്റ്റബിൾ വൈറസാണ് ടിഎംവി. ഉണങ്ങിയ ഇലയിൽ 50 ഡിഗ്രി വരെ 30 മിനിറ്റ് ഇത് അതിജീവിക്കും(120 ഡിഗ്രി ഫാരൻഹീറ്റ്). [6]

ടി‌എം‌വിയുടെ അപവർത്തനാങ്കം, 1.57 ആണ്. [7]

അവലംബങ്ങൾ

  1. PDB 1VTM; Namba K, Stubbs G (March 1986). "Structure of tobacco mosaic virus at 3.6 A resolution: implications for assembly". Science. 231 (4744): 1401–6. doi:10.1126/science.3952490. PMID 3952490.
  2. Stryer, Lubert (1988). Biochemistry. San Francisco: W.H. Freeman. ISBN 978-0-7167-1843-7. {{cite book}}: Unknown parameter |name-list-format= ignored (|name-list-style= suggested) (help)
  3. "The tobacco mosaic virus particle: structure and assembly". Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences. 354 (1383): 531–5. March 1999. doi:10.1098/rstb.1999.0404. PMC 1692534. PMID 10212932.
  4. "Nucleotide sequence of tobacco mosaic virus RNA". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (in English). 79 (19): 5818–22. October 1982. Bibcode:1982PNAS...79.5818G. doi:10.1073/pnas.79.19.5818. PMC 347001. PMID 6964389.{{cite journal}}: CS1 maint: unrecognized language (link)
  5. "Sequence: V01408.1". European Nucleotide Archive (in English). EMBL- EBI. Retrieved 28 March 2020. International central site for archiving nucleic acid sequence. The reference standard in international science.{{cite web}}: CS1 maint: unrecognized language (link)
  6. "Management of Tobacco Mosaic Virus through Natural Metabolites" (PDF). Records of Natural Products: 404. Jan 16, 2018.
  7. "Optical trapping and manipulation of viruses and bacteria". Science. 235 (4795): 1517–20. March 1987. Bibcode:1987Sci...235.1517A. doi:10.1126/science.3547653. PMID 3547653.

കൂടുതൽ വായനയ്ക്ക്

പുറംകണ്ണികൾ